Przyszłość lotniska w Bydgoszczy to niemal temat – „rzeka”. Od wielu miesięcy spekuluje się na temat zmian w zasadach współpracy między władzami portu, a liniami lotniczymi, które oferują tu swoje usługi – w tym zakresie szczególnie istotny był temat związany z irlandzkim Ryanairem, bez którego port miałby spore problemy z należytym funkcjonowaniem i z której to pozycji irlandzki przewoźnik potrafi odpowiednio korzystać.

Zmieniła się również struktura właścicielska portu, wreszcie wiele było również doniesień na temat rozmów między władzami lotniska a operującymi tu liniami lotniczymi – nie tylko Ryanairem, ale również polskimi liniami regionalnymi Jet Air, wiele mówiło się o tym, że w najbliższym czasie przewoźnik może zdecydować się na zaprzestanie współpracy z Bydgoszczą, a to oznaczałoby możliwy koniec lotów z Bydgoszczy do Warszawy, w tym kontekście wymieniany był też inny polski przewoźnik – Polskie Linie Lotnicze LOT, które miały zaproponować ten kierunek w swojej ofercie. Ostatnie doniesienia wskazują na to, że Bydgoszcz połączenia z Warszawą nie straci – oficjalnie nie podano jeszcze informacji dotyczącej tego, który z przewoźników zaproponuje połączenie z warszawskim Okęciem, ale wiele wskazuje na to, że będzie to jednak Jet Air, w najbliższym czasie PLL LOT nie zamierza, bowiem proponować rejsów z Bydgoszczy.